Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT1P21579 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT1P21579 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT1P21579 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms