Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPEP16870 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CPEP16870 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CPEP16870 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CPEP16870 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CPEP16870 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CPEP16870 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CPEP16870 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CPEP16870 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CPEP16870 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CPEP16870 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms