Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAV1P15498 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAV1P15498 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAV1P15498 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAV1P15498 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAV1P15498 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms