Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDPSP14324 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDPSP14324 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDPSP14324 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDPSP14324 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FDPSP14324 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FDPSP14324 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FDPSP14324 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms