Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms