Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP3P08254 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP3P08254 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP3P08254 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MMP3P08254 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms