Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEFMP07197 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms