Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYBBP04839 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYBBP04839 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms