Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C6orf47O95873 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms