Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLIT2O94813 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLIT2O94813 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms