Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF3JO75822 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms