Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN5O75503 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN5O75503 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN5O75503 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms