Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA4O75335 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms