Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFA2T2O43439 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms