Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
J3QR89 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
J3QR89 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
J3QR89 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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