Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
B4E171 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
B4E171 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
B4E171 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
B4E171 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
B4E171 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms