Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
B4DEV8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
B4DEV8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DEV8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DEV8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms