Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYSRT1A8MQ03 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms