Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC169A6NNP5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms