Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POTEMA6NI47 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms