Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF316A6NFI3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms