Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP69A5D8W1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CFAP69A5D8W1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms