Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM30CPA0ZSE6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms