Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CLN3Q13286 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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