Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TRHP20396 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 PABPC4L-201ENST00000421491 4944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC000036.1-201ENST00000449652 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC00547-201ENST00000612438 3314 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TRHP20396 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TRHP20396 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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