Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL591926.2-201ENST00000611780 500 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.72-201ENST00000617458 278 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590491.1-202ENST00000618038 394 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM231C-201ENST00000624031 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMCO1-209ENST00000628579 477 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPKBP1-202ENST00000457542 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAQR5-202ENST00000395407 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SALL4-201ENST00000217086 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K14-202ENST00000376926 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGB4-201ENST00000519479 4578 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SENP3-EIF4A1-201ENST00000614237 3519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SULF1-223ENST00000616868 3381 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 NETO2-201ENST00000303155 3241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB3-201ENST00000394807 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 COG2-202ENST00000366669 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN29-201ENST00000396972 2831 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF529-201ENST00000334116 5238 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365217.1-201ENST00000398578 2436 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM181A-AS1-202ENST00000554742 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARSF-202ENST00000381127 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL15-203ENST00000406787 4304 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158212.3-201ENST00000564352 4237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL1-201ENST00000377844 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MGAT5B-203ENST00000428789 4053 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD9-201ENST00000258436 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000552.1-202ENST00000436681 3714 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF558-207ENST00000601372 7032 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01140-206ENST00000484933 3368 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGK1-204ENST00000367858 3201 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRGUK-201ENST00000285928 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRIT2-201ENST00000372113 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 INPP5B-203ENST00000373024 3060 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIGN-223ENST00000638369 4205 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.6 ms