Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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ZNF548Q8NEK5 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ZNF548Q8NEK5 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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