Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SMIM5-202ENST00000537494 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRMT10A-201ENST00000273962 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 NDST2-201ENST00000299641 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LIMK1-202ENST00000418310 3360 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DAZL-202ENST00000399444 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 STAT1-204ENST00000409465 3097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC87-201ENST00000333861 2908 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PFKM-210ENST00000547587 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF571-AS1-201ENST00000585578 2777 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TXNDC16-201ENST00000281741 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MEF2C-203ENST00000437473 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 STRADA-230ENST00000638702 2140 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LINC01845-201ENST00000518418 2012 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC24A3-202ENST00000613834 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 AC079465.1-201ENST00000416046 3361 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CHCHD5-202ENST00000409719 3272 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GPATCH2-201ENST00000366934 3218 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SAG-201ENST00000409110 1591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC12A3-205ENST00000566786 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF839-206ENST00000558850 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP5-3Q6L8H2 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms