Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FXNQ16595 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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