Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RAB39AQ14964 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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