Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC084759.3-201ENST00000624468 3944 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 ADAM32-201ENST00000379907 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 POLR3B-201ENST00000228347 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 SLC25A44-201ENST00000359511 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 SULT1C2-201ENST00000251481 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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HOXD11P31277 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC009127.2-201ENST00000561979 426 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
HOXD11P31277 AC073476.2-201ENST00000569668 497 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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