Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC4Q9Y696 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC4Q9Y696 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms