Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX8Q9Y5X2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms