Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms