Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HDGFL3Q9Y3E1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HDGFL3Q9Y3E1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms