Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP3Q9Y2W7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms