Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC4Q9Y296 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms