Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMC3Q9UQE7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMC3Q9UQE7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms