Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CEP164Q9UPV0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CEP164Q9UPV0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms