Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAMD4AQ9UPU9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms