Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNPO2Q9UMS6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNPO2Q9UMS6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms