Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFU1Q9UMS0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFU1Q9UMS0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms