Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPCN1Q9ULQ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms