Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSKSQ9UJT2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSKSQ9UJT2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms