Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GPN3Q9UHW5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms