Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT172Q9UG01 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT172Q9UG01 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms