Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFDP1Q9UEE9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFDP1Q9UEE9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms