Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDP1Q9P0J1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms