Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP4R2Q9NY27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4R2Q9NY27 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms