Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PARVAQ9NVD7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms